Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TAF1AQ15573 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TAF1AQ15573 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TAF1AQ15573 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TAF1AQ15573 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TAF1AQ15573 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TAF1AQ15573 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TAF1AQ15573 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TAF1AQ15573 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TAF1AQ15573 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TAF1AQ15573 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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