Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TAF13Q15543 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms