Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms