Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NCF4Q15080 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NCF4Q15080 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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