Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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