Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms