Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NFIXQ14938 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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