Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GTF2H3Q13889 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms