Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CUL4AQ13619 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms