Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C1orf61Q13536 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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