Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PTPN13Q12923 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PTPN13Q12923 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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