Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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KCNMA1Q12791 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMA1Q12791 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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KCNMA1Q12791 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMA1Q12791 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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