Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM193AP78312 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM193AP78312 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM193AP78312 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM193AP78312 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM193AP78312 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM193AP78312 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM193AP78312 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM193AP78312 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM193AP78312 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM193AP78312 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM193AP78312 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM193AP78312 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM193AP78312 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM193AP78312 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms