Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMC1P62191 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms