Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TPTEP56180 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TPTEP56180 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TPTEP56180 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TPTEP56180 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TPTEP56180 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TPTEP56180 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TPTEP56180 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TPTEP56180 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TPTEP56180 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TPTEP56180 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TPTEP56180 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TPTEP56180 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TPTEP56180 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms