Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF6P49848 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF6P49848 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms