Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSR1P43307 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR1P43307 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR1P43307 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR1P43307 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR1P43307 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR1P43307 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR1P43307 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR1P43307 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR1P43307 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR1P43307 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSR1P43307 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSR1P43307 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSR1P43307 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms