Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CHRNA7P36544 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms