Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GLDCP23378 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLDCP23378 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms