Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCP2P22307 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCP2P22307 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCP2P22307 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCP2P22307 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCP2P22307 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCP2P22307 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCP2P22307 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCP2P22307 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCP2P22307 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCP2P22307 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms