Protein–RNA interactions for Protein: P21964

COMT, Catechol O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMTP21964 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMTP21964 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMTP21964 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COMTP21964 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COMTP21964 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMTP21964 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMTP21964 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMTP21964 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMTP21964 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMTP21964 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMTP21964 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMTP21964 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMTP21964 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMTP21964 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMTP21964 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMTP21964 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMTP21964 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMTP21964 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COMTP21964 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COMTP21964 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms