Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRAFP15056 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRAFP15056 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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