Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NR2C1P13056 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms