Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPM2P07951 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPM2P07951 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPM2P07951 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPM2P07951 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPM2P07951 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPM2P07951 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPM2P07951 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPM2P07951 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPM2P07951 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPM2P07951 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPM2P07951 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPM2P07951 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPM2P07951 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPM2P07951 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPM2P07951 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPM2P07951 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPM2P07951 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPM2P07951 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPM2P07951 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TPM2P07951 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPM2P07951 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPM2P07951 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms