Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms