Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LRRTM2O43300 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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