Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-1B6SEH8 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms