Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC169A6NNP5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms