Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SH3BP1Q9Y3L3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms