Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC180Q9P1Z9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms