Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SNX15Q9NRS6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SNX15Q9NRS6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SNX15Q9NRS6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SNX15Q9NRS6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SNX15Q9NRS6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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