Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
A4GALTQ9NPC4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
A4GALTQ9NPC4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms