Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MGME1Q9BQP7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms