Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms