Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 KCNH1-201ENST00000271751 8172 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
RETNLBQ9BQ08 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms