Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NLRP3Q96P20 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 328.9 ms