Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZA3Q96KX2 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms