Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCAF4Q8WV16 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms