Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC112Q8NEF3 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms