Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPAS3Q8IXF0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms