Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SMARCD3Q6STE5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SMARCD3Q6STE5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SMARCD3Q6STE5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SMARCD3Q6STE5 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SMARCD3Q6STE5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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