Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATG9BQ674R7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms