Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNT1Q5JUK3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms