Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms