Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC93Q567U6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms