Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC38Q502W7 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms