Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP2B3Q16720 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms