Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTF1Q16619 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms