Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FXNQ16595 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FXNQ16595 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FXNQ16595 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FXNQ16595 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FXNQ16595 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FXNQ16595 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FXNQ16595 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FXNQ16595 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FXNQ16595 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FXNQ16595 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FXNQ16595 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms