Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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